上水保育園は、社会福祉法人東京家庭学校が運営しています。社会福祉法人東京家庭学校では、そのほかに児童養護施設「東京家庭学校」、心身障害者緊急一時保護事業「光ホーム」を運営しています。これらの施設は、福祉サービスを必要とする者が、心身ともに健やかに育成され、又は社会、経済、文化その他あらゆる分野の活動に参加する機会を与えられるとともに、その環境、年齢及び心身の状況に応じ、地域において必要な福祉サービスを総合的に提供されるように援助することを目的として、基督教精神をもって運営されています。